Mash: fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

Mash extends the MinHash dimensionality-reduction technique to include a pairwise mutation distance and P value significance test, enabling the efficient clustering and search of massive sequence collections. Mash reduces large sequences and sequence sets to small, representative sketches, from whic...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Genome Biology Jg. 17; H. 1; S. 132
Hauptverfasser: Ondov, Brian D., Treangen, Todd J., Melsted, Páll, Mallonee, Adam B., Bergman, Nicholas H., Koren, Sergey, Phillippy, Adam M.
Format: Journal Article
Sprache:Englisch
Veröffentlicht: London BioMed Central 20.06.2016
Springer Nature B.V
Schlagworte:
ISSN:1474-760X, 1474-7596, 1474-760X
Online-Zugang:Volltext
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