Genotyping Polyploids from Messy Sequencing Data

Gerard et al. highlight several issues encountered when genotyping polyploid organisms from next-generation sequencing data, including allelic bias, overdispersion, and outlying observations. They present modeling solutions and software to account for these issues... Detecting and quantifying the di...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	Genetics (Austin) Jg. 210; H. 3; S. 789 - 807
Hauptverfasser:	Gerard, David, Ferrão, Luis Felipe Ventorim, Garcia, Antonio Augusto Franco, Stephens, Matthew
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	United States Genetics Society of America 01.11.2018
Schlagworte:	Bayesian analysis Bias Binomial distribution Bioinformatics Chromosomes Computer simulation Gene sequencing Genetics Genomes Genotype & phenotype Genotyping Investigations Methods Next-generation sequencing Organisms Polyploidy Potatoes Rice Sweet potatoes GBS RAD-Seq read-mapping bias hierarchical modeling sequencing
ISSN:	1943-2631, 0016-6731, 1943-2631
Online-Zugang:	Volltext
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