Statistical Properties of the Branch-Site Test of Positive Selection

The branch-site test is a likelihood ratio test to detect positive selection along prespecified lineages on a phylogeny that affects only a subset of codons in a protein-coding gene, with positive selection indicated by accelerated nonsynonymous substitutions (with ω = dN/dS > 1). This test may h...

Celý popis

Uloženo v:

Podrobná bibliografie
Vydáno v:	Molecular biology and evolution Ročník 28; číslo 3; s. 1217 - 1228
Hlavní autoři:	Yang, Ziheng, dos Reis, Mario
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	United States Society for Molecular Biology and Evolution 01.03.2011 Oxford University Press
Témata:	Animals Codon Computer simulation Computer Simulation - statistics & numerical data Evolution, Molecular Genes Genome Genomics - statistics & numerical data Humans Likelihood Functions Models, Genetic Molecular biology Mutation Open Reading Frames - genetics Phylogenetics Phylogeny Proteins Selection, Genetic Sequence Alignment likelihood ratio test positive selection codon model branch-site test
ISSN:	0737-4038, 1537-1719, 1537-1719
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!