PopLDdecay: a fast and effective tool for linkage disequilibrium decay analysis based on variant call format files

Abstract Motivation Linkage disequilibrium (LD) decay is of great interest in population genetic studies. However, no tool is available now to do LD decay analysis from variant call format (VCF) files directly. In addition, generation of pair-wise LD measurements for whole genome SNPs usually result...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben

Veröffentlicht in:	Bioinformatics Jg. 35; H. 10; S. 1786 - 1788
Hauptverfasser:	Zhang, Chi, Dong, Shan-Shan, Xu, Jun-Yang, He, Wei-Ming, Yang, Tie-Lin
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	England Oxford University Press 15.05.2019
Schlagworte:	bioinformatics computer software genome linkage disequilibrium
ISSN:	1367-4803, 1367-4811, 1460-2059, 1367-4811
Online-Zugang:	Volltext
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