Rapid ab initio prediction of RNA pseudoknots via graph tree decomposition

The prediction of RNA secondary structure including pseudoknots remains a challenge due to the intractable computation of the sequence conformation from nucleotide interactions under free energy models. Optimal algorithms often assume a restricted class for the predicted RNA structures and yet still...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Journal of mathematical biology Ročník 56; číslo 1-2; s. 145 - 159
Hlavní autoři:	Zhao, Jizhen, Malmberg, Russell L., Cai, Liming
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	Berlin/Heidelberg Springer-Verlag 01.01.2008 Springer Nature B.V
Témata:	Algorithms Applications of Mathematics Computational Biology - methods Mathematical and Computational Biology Mathematics Mathematics and Statistics Nucleic Acid Conformation RNA - chemistry Maximum independent set Pseudoknot Tree decomposition Tree width Thermodynamic energy RNA secondary structure prediction
ISSN:	0303-6812, 1432-1416
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!