Lossless Approximate Pattern Matching: Automated Design of Efficient Search Schemes

This study introduces a pioneering approach to automate the creation of search schemes for lossless approximate pattern matching. Search schemes are combinatorial structures that define a series of searches over a partitioned pattern. Each search specifies the processing order of these parts and the...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben

Veröffentlicht in:	Journal of computational biology Jg. 31; H. 10; S. 975
Hauptverfasser:	Renders, Luca, Depuydt, Lore, Rahmann, Sven, Fostier, Jan
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	United States 01.10.2024
Schlagworte:	Algorithms Computational Biology - methods Humans Pattern Recognition, Automated - methods Programming, Linear Software approximate pattern matching integer linear program sequence alignment search schemes
ISSN:	1557-8666, 1557-8666
Online-Zugang:	Weitere Angaben
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