An improved hierarchical variational autoencoder for cell–cell communication estimation using single-cell RNA-seq data

Analysis of cell–cell communication (CCC) in the tumor micro-environment helps decipher the underlying mechanism of cancer progression and drug tolerance. Currently, single-cell RNA-Seq data are available on a large scale, providing an unprecedented opportunity to predict cellular communications. Th...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Briefings in functional genomics Ročník 23; číslo 2; s. 118 - 127
Hlavní autoři:	Liu, Shuhui, Zhang, Yupei, Peng, Jiajie, Shang, Xuequn
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	England 20.03.2024
Témata:	Cell Communication Exome Sequencing Gene Expression Profiling - methods Humans Neoplasms Sequence Analysis, RNA - methods Single-Cell Analysis - methods Single-Cell Gene Expression Analysis Tumor Microenvironment cell–cell communication single-cell RNA-seq data HiVAE model pairwise ligand–receptor transfer entropy
ISSN:	2041-2649, 2041-2657, 2041-2657
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!