A new class of highly efficient exact stochastic simulation algorithms for chemical reaction networks

We introduce an alternative formulation of the exact stochastic simulation algorithm (SSA) for sampling trajectories of the chemical master equation for a well-stirred system of coupled chemical reactions. Our formulation is based on factored-out, partial reaction propensities. This novel exact SSA,...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	The Journal of chemical physics Ročník 130; číslo 24; s. 244104
Hlavní autoři:	Ramaswamy, Rajesh, González-Segredo, Nélido, Sbalzarini, Ivo F
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	United States 28.06.2009
Témata:	Algorithms Colloids - chemistry Computer Simulation Escherichia coli - genetics Escherichia coli - metabolism Escherichia coli Proteins - genetics Escherichia coli Proteins - metabolism Heat-Shock Proteins - genetics Heat-Shock Proteins - metabolism Models, Biological Models, Chemical Stochastic Processes
ISSN:	1089-7690
On-line přístup:	Zjistit podrobnosti o přístupu
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!