DeepUTF: Locating transcription factor binding sites via interpretable dual-channel encoder-decoder structure

•A novel method (DeepUTF) to predict transcription factor binding sites (TFBSs).•DeepUTF captures other relevant patterns in the transcriptional regulatory network.•The feature learning process of the model is interpretable.•Excellent model predictions compared to TF-DNA complexes in the PDB.•DeepUT...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Pattern recognition Ročník 161; s. 111279
Hlavní autoři:	Ding, Pengju, Wang, Jianxin, He, Shiyue, Gao, Xin, Yu, Xu, Yu, Bin
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	Elsevier Ltd 01.05.2025
Témata:	Improved encoder-decoder Interpretability Swin transformer Transcription factor binding sites Swin transformer Transcription factor binding sites Improved encoder-decoder Interpretability
ISSN:	0031-3203
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!