Bibliographic Details
| Title: |
Use of sputum microbiology for identifying lower respiratory tract microbial colonization in patients with obstructive airway disorders. |
| Authors: |
Cameron, Emma Jolene, Wagner, Mitchell, Lam, Grace, Vethanayagam, Dilini |
| Source: |
Canadian Journal of Respiratory, Critical Care, & Sleep Medicine; 2025, Vol. 9 Issue 5, p230-246, 17p |
| Subject Terms: |
SPUTUM microbiology, MEDICAL information storage & retrieval systems, BRONCHIECTASIS, MICROBIAL sensitivity tests, RESPIRATORY diseases, HOST-bacteria relationships, SPUTUM, DESCRIPTIVE statistics, OPERATIVE surgery, SYSTEMATIC reviews, MEDLINE, OBSTRUCTIVE lung diseases, BRONCHOSCOPY, ASTHMA |
| Abstract (English): |
INTRODUCTION: Lower respiratory tract microbial colonization caused by bacterial pathogens in patients with obstructive airway disorders, such as asthma, bronchiectasis and chronic obstructive pulmonary disease (COPD), can lead to worsened clinical outcomes and increased costs associated with the disease to both the healthcare system and patients. Thus, efforts to identify the etiology of the infection are critical to effective treatment. The analysis of expectorated sputum collected from individuals can be diagnostic and allow for noninvasive sampling, causing it to historically be considered the preferred method of diagnosis. However, discourse surrounding the diagnostic utility with current and easier to access techniques including invasive procedures, such as bronchoscopy, have led to changing patterns of assessment, which can also impact costs to the health system. METHODS: A systematic review of literature from Embase, Medline and Scopus databases was conducted to compile records regarding the use of sputum microbiology in patients with one of the aforementioned obstructive airway disorders but without pneumonia. We compared two broad techniques within sputum microbiology: sputum culture and sequencing. RESULTS: We found that while sequencing often identified specific species at a higher frequency, sputum culture methods identified a larger diversity of bacterial species. CONCLUSIONS: The current literature has a disproportionate representation of COPD and patients over the age of 60. There is a lack of consensus regarding what is deemed a conventional method. Future studies should evaluate the role of sequencing, including costs, when considering implementation into clinical laboratories, particularly in a single payer system such as in Canada and the United Kingdom. [ABSTRACT FROM AUTHOR] |
| Abstract (French): |
Chez les patients atteints de troubles obstructifs des voies respiratoires, tels que l'asthme, la bronchiectasie ou la MPOC, la colonisation des voies respiratoires inférieures par des agents pathogènes bactériens peut aggraver les issues cliniques et entraîner une hausse des coûts liés à la maladie, tant pour le système de santé que pour les patients. Il est donc essentiel de déterminer l'étiologie de l'infection afin de mettre en place un traitement efficace. L'analyse des expectorations prélevées chez les individus peut avoir une valeur diagnostique et constitue une méthode non invasive d'échantillonnage, ce qui en a historiquement fait l'approche privilégiée. Toutefois, les discussions entourant l'utilité diagnostique des techniques actuelles, plus accessibles, incluant certaines procédures invasives comme la bronchoscopie, ont entraîné une évolution des modèles d'évaluation, ce qui peut également avoir une incidence sur les coûts pour le système de santé. Une revue systématique de la littérature provenant des bases de données Embase, MEDLINE et Scopus a été menée afin de recenser des publications portant sur l'utilisation de la microbiologie des expectorations chez des patients atteints de l'un des troubles obstructifs des voies respiratoires susmentionnés, en l'absence de pneumonie. Deux grandes techniques de microbiologie des expectorations ont été comparées : la culture des expectorations et le séquençage. Nous avons constaté que, bien que le séquençage détectait souvent certaines espèces à une fréquence plus élevée, les méthodes de culture des expectorations permettaient de détecter une plus grande diversité d'espèces bactériennes. La MPOC et les patients âgés de plus de 60 ans sont représentés de manière disproportionnée dans la littérature actuelle. La définition de ce qui constitue une « méthode conventionnelle » ne fait pas consensus. Les recherches futures devraient évaluer le rôle du séquençage— y compris les coûts—lorsque son implantation dans les laboratoires cliniques est envisagée, particulièrement dans un système à payeur unique comme ceux du Canada et du Royaume-Uni. [ABSTRACT FROM AUTHOR] |
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