Introducing difference recurrence relations for faster semi-global alignment of long sequences

Background The read length of single-molecule DNA sequencers is reaching 1 Mb. Popular alignment software tools widely used for analyzing such long reads often take advantage of single-instruction multiple-data (SIMD) operations to accelerate calculation of dynamic programming (DP) matrices in the S...

Celý popis

Uloženo v:

Podrobná bibliografie
Vydáno v:	BMC bioinformatics Ročník 19; číslo Suppl 1; s. 45 - 47
Hlavní autoři:	Suzuki, Hajime, Kasahara, Masahiro
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	London BioMed Central 19.02.2018 BioMed Central Ltd BMC
Témata:	Algorithms Alignment Base sequence Bioinformatics Biomedical and Life Sciences Computational Biology/Bioinformatics Computer Appl. in Life Sciences Humans Life Sciences Long read Methodology Microarrays Sequence Alignment - methods Sequence analysis Sequence Analysis, DNA - methods Software Sequence analysis Alignment Long read
ISSN:	1471-2105, 1471-2105
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!