rapidGSEA: Speeding up gene set enrichment analysis on multi-core CPUs and CUDA-enabled GPUs

Background Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) is a popular method to reveal significant dependencies between predefined sets of gene symbols and observed phenotypes by evaluating the deviation of gene expression values between cases and controls. An established measure of inter-class deviation, the...

Celý popis

Uloženo v:

Podrobná bibliografie
Vydáno v:	BMC bioinformatics Ročník 17; číslo 1; s. 394
Hlavní autoři:	Hundt, Christian, Hildebrandt, Andreas, Schmidt, Bertil
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	London BioMed Central 23.09.2016 BioMed Central Ltd Springer Nature B.V
Témata:	Algorithms Bioinformatics Biomedical and Life Sciences Computational Biology/Bioinformatics Computer Appl. in Life Sciences Gene expression Graphics coprocessors Life Sciences Microarrays Multiprocessing Physiological aspects Public software Software Transcriptome analysis Germany CUDA Gene set enrichment analysis Gene expression data Resampling statistics
ISSN:	1471-2105, 1471-2105
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!