Simultaneous reconstruction of evolutionary history and epidemiological dynamics from viral sequences with the birth-death SIR model

The evolution of RNA viruses, such as human immunodeficiency virus (HIV), hepatitis C virus and influenza virus, occurs so rapidly that the viruses' genomes contain information on past ecological dynamics. Hence, we develop a phylodynamic method that enables the joint estimation of epidemiologi...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	Journal of the Royal Society interface Jg. 11; H. 94; S. 20131106
Hauptverfasser:	Kühnert, Denise, Stadler, Tanja, Vaughan, Timothy G, Drummond, Alexei J
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	England 06.05.2014
Schlagworte:	Argentina - epidemiology Genotype Hepacivirus - genetics Hepatitis C - epidemiology Hepatitis C - genetics HIV Infections - epidemiology HIV Infections - genetics HIV-1 - immunology Humans Models, Biological Phylogeny United Kingdom - epidemiology mathematical epidemiology Bayesian phylogenetics birth–death prior phylodynamics
ISSN:	1742-5662, 1742-5662
Online-Zugang:	Weitere Angaben
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Schreiben Sie den ersten Kommentar!