STalign: Alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping

Spatial transcriptomics (ST) technologies enable high throughput gene expression characterization within thin tissue sections. However, comparing spatial observations across sections, samples, and technologies remains challenging. To address this challenge, we develop STalign to align ST datasets in...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	Nature communications Jg. 14; H. 1; S. 8123 - 14
Hauptverfasser:	Clifton, Kalen, Anant, Manjari, Aihara, Gohta, Atta, Lyla, Aimiuwu, Osagie K., Kebschull, Justus M., Miller, Michael I., Tward, Daniel, Fan, Jean
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	London Nature Publishing Group UK 08.12.2023 Nature Publishing Group Nature Portfolio
Schlagworte:	13/51 38/32 38/91 49/39 631/114/1305 631/114/2397 631/114/2401 631/208/199 631/61/514/1949 Animals Annotations Brain Datasets Gene expression Gene Expression Profiling Gene mapping Heterogeneity Humanities and Social Sciences Interrogation Mapping Mice multidisciplinary Science Science (multidisciplinary) Software Spatial data Technology Transcriptomics
ISSN:	2041-1723, 2041-1723
Online-Zugang:	Volltext
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