Current Methods for Automated Filtering of Multiple Sequence Alignments Frequently Worsen Single-Gene Phylogenetic Inference

Abstract Phylogenetic inference is generally performed on the basis of multiple sequence alignments (MSA). Because errors in an alignment can lead to errors in tree estimation, there is a strong interest in identifying and removing unreliable parts of the alignment. In recent years several automated...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Systematic biology Ročník 64; číslo 5; s. 778 - 791
Hlavní autoři:	Tan, Ge, Muffato, Matthieu, Ledergerber, Christian, Herrero, Javier, Goldman, Nick, Gil, Manuel, Dessimoz, Christophe
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	England Oxford University Press 01.09.2015
Témata:	Algorithms Classification - methods Genome - genetics Phylogeny Reproducibility of Results Sequence Alignment phylogenetic inference alignment trimming alignment filtering molecular phylogeny multiple sequence alignment phylogeny phylogenetics
ISSN:	1063-5157, 1076-836X, 1076-836X
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!