UCell: Robust and scalable single-cell gene signature scoring

UCell is an R package for evaluating gene signatures in single-cell datasets. UCell signature scores, based on the Mann-Whitney U statistic, are robust to dataset size and heterogeneity, and their calculation demands less computing time and memory than other available methods, enabling the processin...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben

Veröffentlicht in:	Computational and structural biotechnology journal Jg. 19; S. 3796 - 3798
Hauptverfasser:	Andreatta, Massimo, Carmona, Santiago J.
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	Elsevier B.V 01.01.2021 Research Network of Computational and Structural Biotechnology Elsevier
Schlagworte:	biotechnology Cell type data collection Gene set enrichment Gene signature genes memory Module scoring Single-cell Gene signature Gene set enrichment Module scoring Cell type Single-cell
ISSN:	2001-0370, 2001-0370
Online-Zugang:	Volltext
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