NMMD: Efficient Cryo-EM Flexible Fitting Based on Simultaneous Normal Mode and Molecular Dynamics atomic displacements

[Display omitted] •NMMD: new method for flexible fitting of atomic structures into cryo-EM maps.•NMMD efficiently combines normal mode analysis and molecular dynamics simulation.•NMMD was tested using synthetic and experimental cryo-EM maps.•Adding normal modes to molecular dynamics makes the fittin...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Journal of molecular biology Jg. 434; H. 7; S. 167483
Hauptverfasser: Vuillemot, Rémi, Miyashita, Osamu, Tama, Florence, Rouiller, Isabelle, Jonic, Slavica
Format: Journal Article
Sprache:Englisch
Veröffentlicht: Netherlands Elsevier Ltd 15.04.2022
Elsevier
Schlagworte:
ISSN:0022-2836, 1089-8638, 1089-8638
Online-Zugang:Volltext
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