KofamKOALA: KEGG Ortholog assignment based on profile HMM and adaptive score threshold

Abstract Summary KofamKOALA is a web server to assign KEGG Orthologs (KOs) to protein sequences by homology search against a database of profile hidden Markov models (KOfam) with pre-computed adaptive score thresholds. KofamKOALA is faster than existing KO assignment tools with its accuracy being co...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	Bioinformatics Jg. 36; H. 7; S. 2251 - 2252
Hauptverfasser:	Aramaki, Takuya, Blanc-Mathieu, Romain, Endo, Hisashi, Ohkubo, Koichi, Kanehisa, Minoru, Goto, Susumu, Ogata, Hiroyuki
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	England Oxford University Press 01.04.2020
Schlagworte:	Applications Notes
ISSN:	1367-4803, 1367-4811, 1460-2059, 1367-4811
Online-Zugang:	Volltext
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