KofamKOALA: KEGG Ortholog assignment based on profile HMM and adaptive score threshold

Abstract Summary KofamKOALA is a web server to assign KEGG Orthologs (KOs) to protein sequences by homology search against a database of profile hidden Markov models (KOfam) with pre-computed adaptive score thresholds. KofamKOALA is faster than existing KO assignment tools with its accuracy being co...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Bioinformatics Ročník 36; číslo 7; s. 2251 - 2252
Hlavní autoři:	Aramaki, Takuya, Blanc-Mathieu, Romain, Endo, Hisashi, Ohkubo, Koichi, Kanehisa, Minoru, Goto, Susumu, Ogata, Hiroyuki
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	England Oxford University Press 01.04.2020
Témata:	Applications Notes
ISSN:	1367-4803, 1367-4811, 1460-2059, 1367-4811
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!