YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool

Abstract Summary We present YaHS, a user-friendly command-line tool for the construction of chromosome-scale scaffolds from Hi-C data. It can be run with a single-line command, requires minimal input from users (an assembly file and an alignment file) which is compatible with similar tools and provi...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Bioinformatics (Oxford, England) Ročník 39; číslo 1
Hlavní autoři:	Zhou, Chenxi, McCarthy, Shane A, Durbin, Richard
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	England Oxford University Press 01.01.2023 Oxford Publishing Limited (England)
Témata:	Assembly Availability Bioinformatics Documentation Scaffolding Software Source code User requirements
ISSN:	1367-4803, 1367-4811, 1367-4811
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!