PopLDdecay: a fast and effective tool for linkage disequilibrium decay analysis based on variant call format files

Abstract Motivation Linkage disequilibrium (LD) decay is of great interest in population genetic studies. However, no tool is available now to do LD decay analysis from variant call format (VCF) files directly. In addition, generation of pair-wise LD measurements for whole genome SNPs usually result...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Bioinformatics Ročník 35; číslo 10; s. 1786 - 1788
Hlavní autoři:	Zhang, Chi, Dong, Shan-Shan, Xu, Jun-Yang, He, Wei-Ming, Yang, Tie-Lin
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	England Oxford University Press 15.05.2019
Témata:	bioinformatics computer software genome linkage disequilibrium
ISSN:	1367-4803, 1367-4811, 1460-2059, 1367-4811
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!