Gene count estimation with pytximport enables reproducible analysis of bulk RNA sequencing data in Python

Summary Transcript quantification tools efficiently map bulk RNA sequencing (RNA-seq) reads to reference transcriptomes. However, their output consists of transcript count estimates that are subject to multiple biases and cannot be readily used with existing differential gene expression analysis too...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Bioinformatics (Oxford, England) Jg. 40; H. 12
Hauptverfasser: Kuehl, Malte, Wong, Milagros N, Wanner, Nicola, Bonn, Stefan, Puelles, Victor G
Format: Journal Article
Sprache:Englisch
Veröffentlicht: England Oxford University Press 28.11.2024
Oxford Publishing Limited (England)
Schlagworte:
ISSN:1367-4811, 1367-4803, 1367-4811
Online-Zugang:Volltext
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