Gene count estimation with pytximport enables reproducible analysis of bulk RNA sequencing data in Python

Summary Transcript quantification tools efficiently map bulk RNA sequencing (RNA-seq) reads to reference transcriptomes. However, their output consists of transcript count estimates that are subject to multiple biases and cannot be readily used with existing differential gene expression analysis too...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Vydáno v:Bioinformatics (Oxford, England) Ročník 40; číslo 12
Hlavní autoři: Kuehl, Malte, Wong, Milagros N, Wanner, Nicola, Bonn, Stefan, Puelles, Victor G
Médium: Journal Article
Jazyk:angličtina
Vydáno: England Oxford University Press 28.11.2024
Oxford Publishing Limited (England)
Témata:
ISSN:1367-4811, 1367-4803, 1367-4811
On-line přístup:Získat plný text
Tagy: Přidat tag
Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!
Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!
Nejprve se musíte přihlásit.