GTDB-Tk v2: memory friendly classification with the genome taxonomy database

The Genome Taxonomy Database (GTDB) and associated taxonomic classification toolkit (GTDB-Tk) have been widely adopted by the microbiology community. However, the growing size of the GTDB bacterial reference tree has resulted in GTDB-Tk requiring substantial amounts of memory (∼320 GB) which limits...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	Bioinformatics (Oxford, England) Jg. 38; H. 23; S. 5315 - 5316
Hauptverfasser:	Chaumeil, Pierre-Alain, Mussig, Aaron J, Hugenholtz, Philip, Parks, Donovan H
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	England Oxford University Press 30.11.2022
Schlagworte:	Applications Note Documentation Software
ISSN:	1367-4803, 1367-4811, 1367-4811
Online-Zugang:	Volltext
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