GTDB-Tk v2: memory friendly classification with the genome taxonomy database

The Genome Taxonomy Database (GTDB) and associated taxonomic classification toolkit (GTDB-Tk) have been widely adopted by the microbiology community. However, the growing size of the GTDB bacterial reference tree has resulted in GTDB-Tk requiring substantial amounts of memory (∼320 GB) which limits...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Bioinformatics (Oxford, England) Ročník 38; číslo 23; s. 5315 - 5316
Hlavní autoři:	Chaumeil, Pierre-Alain, Mussig, Aaron J, Hugenholtz, Philip, Parks, Donovan H
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	England Oxford University Press 30.11.2022
Témata:	Applications Note Documentation Software
ISSN:	1367-4803, 1367-4811, 1367-4811
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!