A bit-parallel dynamic programming algorithm suitable for DNA sequence alignment

Myers' elegant and powerful bit-parallel dynamic programming algorithm for approximate string matching has a restriction that the query length should be within the word size of the computer, typically 64. We propose a modification of Myers' algorithm, in which the modification has a restri...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Journal of bioinformatics and computational biology Ročník 10; číslo 4; s. 1250002
Hlavní autoři:	Kimura, Kouichi, Koike, Asako, Nakai, Kenta
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	Singapore 01.08.2012
Témata:	Algorithms Base Sequence Computational Biology DNA - chemistry Genome Sequence Alignment Sequence Analysis, DNA
ISSN:	1757-6334, 1757-6334
On-line přístup:	Zjistit podrobnosti o přístupu
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!