Data compression and genomes: A two-dimensional life domain map

We define the complexity of DNA sequences as the information content per nucleotide, calculated by means of some Lempel–Ziv data compression algorithm. It is possible to use the statistics of the complexity values of the functional regions of different complete genomes to distinguish among genomes o...

Celý popis

Uloženo v:

Podrobná bibliografie
Vydáno v:	Journal of theoretical biology Ročník 253; číslo 2; s. 281 - 288
Hlavní autoři:	Menconi, Giulia, Benci, Vieri, Buiatti, Marcello
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	England Elsevier Ltd 21.07.2008
Témata:	Algorithms Animals Archaea Base Sequence Data Compression - methods DNA - genetics DNA sequences Evolution, Molecular Evolutionary dynamics Genome Lempel–Ziv compression Models, Genetic Statistical analysis Lempel–Ziv compression Statistical analysis Algorithms DNA sequences Evolutionary dynamics
ISSN:	0022-5193, 1095-8541, 1095-8541
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!