Data compression and genomes: A two-dimensional life domain map

We define the complexity of DNA sequences as the information content per nucleotide, calculated by means of some Lempel–Ziv data compression algorithm. It is possible to use the statistics of the complexity values of the functional regions of different complete genomes to distinguish among genomes o...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	Journal of theoretical biology Jg. 253; H. 2; S. 281 - 288
Hauptverfasser:	Menconi, Giulia, Benci, Vieri, Buiatti, Marcello
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	England Elsevier Ltd 21.07.2008
Schlagworte:	Algorithms Animals Archaea Base Sequence Data Compression - methods DNA - genetics DNA sequences Evolution, Molecular Evolutionary dynamics Genome Lempel–Ziv compression Models, Genetic Statistical analysis Lempel–Ziv compression Statistical analysis Algorithms DNA sequences Evolutionary dynamics
ISSN:	0022-5193, 1095-8541, 1095-8541
Online-Zugang:	Volltext
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