Improving ligand‐ranking of AutoDock Vina by changing the empirical parameters

AutoDock Vina (Vina) achieved a very high docking‐success rate, p^, but give a rather low correlation coefficient, R, for binding affinity with respect to experiments. This low correlation can be an obstacle for ranking of ligand‐binding affinity, which is the main objective of docking simulations....

Celý popis

Uloženo v:

Podrobná bibliografie
Vydáno v:	Journal of computational chemistry Ročník 43; číslo 3; s. 160 - 169
Hlavní autoři:	Pham, T. Ngoc Han, Nguyen, Trung Hai, Tam, Nguyen Minh, Y. Vu, Thien, Pham, Nhat Truong, Huy, Nguyen Truong, Mai, Binh Khanh, Tung, Nguyen Thanh, Pham, Minh Quan, V. Vu, Van, Ngo, Son Tung
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	Hoboken, USA John Wiley & Sons, Inc 30.01.2022 Wiley Subscription Services, Inc
Témata:	Affinity AutoDock Vina Binding binding affinity Correlation coefficients Docking empirical parameter Hydrogen bonds Ligands Mathematical analysis modified Vina Parameters Ranking screening binding affinity screening empirical parameter AutoDock Vina modified Vina
ISSN:	0192-8651, 1096-987X, 1096-987X
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!