IMATAC imputes single-cell ATAC-seq data by deep hierarchical network with denoising autoencoder

Abstract Single-cell ATAC-seq (scATAC-seq) technology allows the interrogation of chromatin accessibility of individual cells. Dropout events occur while the sequencing data signals at some bona fide chromatin sites of individuals are not captured, and the curse of these dropouts in scATAC-seq data...

Celý popis

Uloženo v:

Podrobná bibliografie
Vydáno v:	Briefings in bioinformatics Ročník 26; číslo 5
Hlavní autoři:	Li, Yao, Lyu, Hongqiang, Li, Kexin, Liu, Yuan, Zhang, Xinman, Liu, Ze, Jing, Pengcheng, Han, Peng
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	England Oxford University Press 01.09.2025 Oxford Publishing Limited (England)
Témata:	Algorithms Autoencoder Chromatin Chromatin Immunoprecipitation Sequencing - methods Clustering Comparative analysis Computational Biology - methods Humans Interrogation Noise reduction Single-Cell Analysis - methods Software hierarchical network denoising autoencoder single-cell ATAC-seq imputation
ISSN:	1467-5463, 1477-4054, 1477-4054
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!