Space Efficient Merging of de Bruijn Graphs and Wheeler Graphs

The merging of succinct data structures is a well established technique for the space efficient construction of large succinct indexes. In the first part of the paper we propose a new algorithm for merging succinct representations of de Bruijn graphs . Our algorithm has the same asymptotic cost of t...

Celý popis

Uloženo v:

Podrobná bibliografie
Vydáno v:	Algorithmica Ročník 84; číslo 3; s. 639 - 669
Hlavní autoři:	Egidi, Lavinia, Louza, Felipe A., Manzini, Giovanni
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	New York Springer US 01.03.2022 Springer Nature B.V
Témata:	Algorithm Analysis and Problem Complexity Algorithms Asymptotic properties Computer Science Computer Systems Organization and Communication Networks Data structures Data Structures and Information Theory Graph theory Graphical representations Graphs Mathematics of Computing Special Issue from London Stringology Days & London Algorithmic Workshop Theory of Computation Succinct data structures Space efficient algorithms de Bruijn graphs Wheeler graphs BWT variants
ISSN:	0178-4617, 1432-0541
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!