A Modified Median String Algorithm for Gene Regulatory Motif Classification

Consensus string is a significant feature of a deoxyribonucleic acid (DNA) sequence. The median string is one of the most popular exact algorithms to find DNA consensus. A DNA sequence is represented using the alphabet Σ= {a, c, g, t}. The algorithm generates a set of all the 4l possible motifs or l...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	Symmetry (Basel) Jg. 12; H. 8; S. 1363
Hauptverfasser:	Kaysar, Mohammad Shibli, Khan, Mohammad Ibrahim
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	Basel MDPI AG 01.08.2020
Schlagworte:	Algorithms Alphabets Deoxyribonucleic acid DNA Experiments Markov analysis Markov chains Probability Statistical analysis Strings
ISSN:	2073-8994, 2073-8994
Online-Zugang:	Volltext
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