Fast and Memory-Efficient Dynamic Programming Approach for Large-Scale EHH-Based Selection Scans

Abstract Haplotype-based statistics are widely used for finding genomic regions under positive selection. At the heart of many such statistics is the computation of extended haplotype homozygosity (EHH), which captures the decay of homozygosity away from a focal site. This computation, repeated for...

Celý popis

Uloženo v:

Podrobná bibliografie
Vydáno v:	Molecular biology and evolution Ročník 42; číslo 11
Hlavní autoři:	Rahman, Amatur, Smith, T Quinn, Szpiech, Zachary A
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	UK Oxford University Press 01.11.2025
Témata:	Algorithms Computation Computer Simulation Dynamic Programming Genomics Genotypes Haplotypes Homozygosity Homozygote Humans Machine learning Models, Genetic Positive selection Run time (computers) Selection, Genetic Software Source code Statistics population genetics haplotypes positive selection software
ISSN:	0737-4038, 1537-1719, 1537-1719
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!

Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!