PVGwfa: a multi-level parallel sequence-to-graph alignment algorithm

A pangenome graph represents the genomes of multiple individuals, offering a comprehensive reference and overcoming allele bias from linear reference genomes. Sequence-to-graph alignment, crucial for pangenome tasks, aligns sequences to a graph to find the best matches. However, existing algorithms...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	The Journal of supercomputing Ročník 81; číslo 5; s. 743
Hlavní autoři:	Peng, Chenchen, Xia, Zeyu, Tang, Shengbo, Guo, Yifei, Yang, Canqun, Tang, Tao, Cui, Yingbo
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	New York Springer Nature B.V 15.04.2025
Témata:	Algorithms Alignment Datasets Dynamic programming Efficiency Genomes Graphs Optimization Parallel processing Source code
ISSN:	1573-0484, 0920-8542, 1573-0484
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!