High-Performance Sorting-Based k-mer Counting in Distributed Memory with Flexible Hybrid Parallelism

In generating large quantities of DNA data, high-throughput sequencing technologies require advanced bioinformatics infrastructures for efficient data analysis. k-mer counting, the process of quantifying the frequency of fixed-length k DNA subsequences, is a fundamental step in various bioinformatic...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	arXiv.org
Hlavní autoři:	Li, Yifan, Guidi, Giulia
Médium:	Paper
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	Ithaca Cornell University Library, arXiv.org 10.07.2024
Témata:	Assembly Bioinformatics Data analysis Deoxyribonucleic acid Distributed memory DNA Gene sequencing Genomes Nodes Pipelining (computers) Software
ISSN:	2331-8422
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!