Colander: a probability-based support vector machine algorithm for automatic screening for CID spectra of phosphopeptides prior to database search

We developed a probability-based machine-learning program, Colander, to identify tandem mass spectra that are highly likely to represent phosphopeptides prior to database search. We identified statistically significant diagnostic features of phosphopeptide tandem mass spectra based on ion trap CID M...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	Journal of proteome research Ročník 7; číslo 8; s. 3628
Hlavní autoři:	Lu, Bingwen, Ruse, Cristian I, Yates, 3rd, John R
Médium:	Journal Article
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	United States 01.08.2008
Témata:	Algorithms Chromatography, Liquid Databases, Factual Pattern Recognition, Automated Phosphopeptides - analysis Phosphorylation Probability Saccharomyces cerevisiae - metabolism Saccharomyces cerevisiae Proteins - analysis Tandem Mass Spectrometry
ISSN:	1535-3893
On-line přístup:	Zjistit podrobnosti o přístupu
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!