PaCS-Q: Python Toolkits for Path Sampling in MD and QM/MM MD Simulation

PaCS-Q is an open-source Python toolkit that simplifies QM/MM MD and MD simulations, making complex pathway sampling accessible and user-friendly. Seamlessly integrated with the AMBER MD suite, it automates QM/MM MD simulations using the parallel cascade selection (PaCS) algorithm, enabling efficien...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:	Journal of chemical information and modeling Jg. 65; H. 13; S. 6441
Hauptverfasser:	Duan, Lian, Hengphasatporn, Kowit, Shigeta, Yasuteru
Format:	Journal Article
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	United States 14.07.2025
Schlagworte:	Algorithms Molecular Dynamics Simulation Quantum Theory Software
ISSN:	1549-960X, 1549-960X
Online-Zugang:	Weitere Angaben
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