TSUNAMI: A GPU Implementation of the WFA Algorithm

Pairwise sequence alignment represents a fundamental step in the genome assembly pipeline, being the most time-consuming step and the bottleneck factor in multiple bioinformatics applications. Exact pairwise alignment methods like Smith-Waterman and Needleman-Wunsch, often cannot satisfy the perform...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	2023 32nd International Conference on Parallel Architectures and Compilation Techniques (PACT) s. 150 - 161
Hlavní autoři:	Gerometta, Giulia, Zeni, Alberto, Santambrogio, Marco D.
Médium:	Konferenční příspěvek
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	IEEE 21.10.2023
Témata:	Genome Alignment GPU Graphics processing units HPC Pipelines Rendering (computer graphics) Silver Software Software algorithms Tsunami WFA
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!