BLESS: Bandwidth and Locality Enhanced SMEM Seeding Acceleration for DNA Sequencing

In an era marked by the pervasive spread of harmful viruses like COVID-19, the importance of DNA sequencing has grown significantly, given its crucial role in devising effective countermeasures. The seeding process, which aims to find locations of super-maximal exact matches (SMEM) between the DNA s...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	2024 ACM/IEEE 51st Annual International Symposium on Computer Architecture (ISCA) s. 582 - 596
Hlavní autoři:	Han, Seunghee, Moon, Seungjae, Suh, Teokkyu, Heo, JaeHoon, Kim, Joo-Young
Médium:	Konferenční příspěvek
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	IEEE 29.06.2024
Témata:	Bandwidth Data Locality DNA DNA Sequencing Genomics Hardware Accelerator Memory management Read Alignment Runtime Sequential analysis SMEM Seeding Software-Hardware Co-design Switches System performance
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!