From Scripted HPC-Based NGS Pipelines to Workflows on the Cloud

In this paper we describe our initial experiences in the Cloud-e-Genome project with moving the whole exome sequencing pipeline from the scripted HPC-based solution to a workflow enactment system running in the cloud. We discuss shortcomings of the existing approach based on scripts and list benefit...

Ausführliche Beschreibung

Bibliographische Detailangaben

Veröffentlicht in:	2014 14th IEEE/ACM International Symposium on Cluster, Cloud and Grid Computing S. 694 - 700
Hauptverfasser:	Cala, Jacek, Yaobo Xu, Wijaya, Eldarina Azfar, Missier, Paolo
Format:	Tagungsbericht
Sprache:	Englisch
Veröffentlicht:	IEEE 01.05.2014
Schlagworte:	Bioinformatics Cloud computing Computational modeling Genomics Libraries Pipelines
Online-Zugang:	Volltext
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!