From Scripted HPC-Based NGS Pipelines to Workflows on the Cloud

In this paper we describe our initial experiences in the Cloud-e-Genome project with moving the whole exome sequencing pipeline from the scripted HPC-based solution to a workflow enactment system running in the cloud. We discuss shortcomings of the existing approach based on scripts and list benefit...

Celý popis

Podrobná bibliografie

Vydáno v:	2014 14th IEEE/ACM International Symposium on Cluster, Cloud and Grid Computing s. 694 - 700
Hlavní autoři:	Cala, Jacek, Yaobo Xu, Wijaya, Eldarina Azfar, Missier, Paolo
Médium:	Konferenční příspěvek
Jazyk:	angličtina
Vydáno:	IEEE 01.05.2014
Témata:	Bioinformatics Cloud computing Computational modeling Genomics Libraries Pipelines
On-line přístup:	Získat plný text
Tagy:	Přidat tag Žádné tagy, Buďte první, kdo vytvoří štítek k tomuto záznamu!