Сравнительный морфологический анализ тканей печени данио (Danio rerio), японской медаки (Oryzias latipes) и нотобранхиуса Гюнтера (Nothobranchius guentheri) методами гистоморфометрии и графового моделирования

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Název: Сравнительный морфологический анализ тканей печени данио (Danio rerio), японской медаки (Oryzias latipes) и нотобранхиуса Гюнтера (Nothobranchius guentheri) методами гистоморфометрии и графового моделирования
Informace o vydavateli: ООО Цифра, 2025.
Rok vydání: 2025
Témata: триангуляция делоне, principal component analysis, Delaunay triangulation, цитоархитектоника, model organisms, анализ изображений, анализ главных компонент, cytoarchitectonics, image analysis, tissue topology, топология ткани, hepatocytes, гепатоциты, модельные организмы
Popis: В настоящем исследовании проведен сравнительный анализ гистоарихтектоники печени трех лабораторных видов рыб: данио, японской медаки и нотобранхиуса Гюнтера, являющихся широко используемыми модельными объектами. Для этого был применен комплексный подход, сочетающий классическую гистоморфометрию и графовое моделирование для количественной оценки пространственной организации гепатоцитов. Гистоморфометрический анализ выявил значительные видовые различия в размере и форме ядер гепатоцитов, при этом у нотобранхиуса наблюдались наибольшие значения площади (17,59 мкм²), периметра (17,03 мкм) и диаметра Фере (6,02 мкм). Графовый анализ, основанный на триангуляции Делоне и методе k-ближайших соседей, показал, что ткань печени данио характеризуется разреженной организацией гепатоцитов в виде небольших, удаленных друг от друга кластеров. В отличие от этого, у медаки и нотобранхиуса гепатоциты формировали более плотные и связанные клеточные кластеры. Анализ главных компонент (PCA) успешно разделил три вида на отдельные кластеры, подтвердив, что основной вклад в различия вносят морфометрия ядер и топологические метрики сети (расстояние до соседей, модулярность). Результаты демонстрируют, что интеграция графового моделирования с гистоморфометрией предоставляет мощный инструмент для детальной и количественной характеристики видоспецифических особенностей тканевой архитектуры рыб.
This research conducted a comparative analysis of the histoarchitecture of the liver of three laboratory fish species: danio, Japanese medaka, and Gunther's notobranch, which are widely used model organisms. A complex approach was used, combining classical histomorphometry and graph modelling for quantitative evaluation of the spatial organisation of hepatocytes. Histomorphometric analysis showed significant species differences in the size and shape of hepatocyte nuclei, with notobranch having the largest values for area (17.59 μm²), perimeter (17.03 μm), and feret diameter (6.02 μm). Graph analysis based on Delaunay triangulation and the K-Nearest Neighbours method showed that danio liver tissue is characterised by a sparse organisation of hepatocytes in the form of small, distant clusters. In contrast, in medaka and notobranch, hepatocytes formed denser and more connected cell clusters. Principal component analysis (PCA) successfully separated the three species into distinct clusters, confirming that the main difference lies in the morphometry of the nuclei and the topological metrics of the network (distance to neighbours, modularity). The results demonstrate that the integration of graph modelling with histomorphometry provides a powerful tool for detailed and quantitative characterisation of species-specific features of fish tissue architecture.
Journal of Agriculture and Environment, Выпуск 9 (61) 2025
Druh dokumentu: Article
Jazyk: Russian
DOI: 10.60797/jae.2025.61.9
Rights: CC BY
Přístupové číslo: edsair.doi...........36459d782c6bdd0e4460a0b2c9f0fd3d
Databáze: OpenAIRE
Buďte první, kdo okomentuje tento záznam!
Nejprve se musíte přihlásit.