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Considerations and recommendations from the ISMRM Diffusion Study Group for preclinical diffusion MRI: Part 3—Ex vivo imaging: Data processing, comparisons with microscopy, and tractography: Part 3-Ex vivo imaging: Data processing, comparisons with microscopy, and tractography

Autoři: Kurt G. Schilling Amy F. D. Howard Francesco Grussu a další

Přispěvatelé: Kurt G. Schilling Amy F. D. Howard Francesco Grussu a další

Zdroj: Magn Reson Med
Scientia
Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salut
instname
Magnetic resonance in medicine, vol. 93, no. 6, pp. 2561-2582
Magnetic resonance in medicine
Schilling, K G, Howard, A FD, Grussu, F, Ianus, A, Hansen, B, Barrett, R L C, Aggarwal, M, Michielse, S, Nasrallah, F, Syeda, W, Wang, N, Veraart, J, Roebroeck, A, Bagdasarian, A F, Eichner, C, Sepehrband, F, Zimmermann, J, Soustelle, L, Bowman, C, Tendler, B C, Hertanu, A, Jeurissen, B, Verhoye, M, Frydman, L, van de Looij, Y, Hike, D, Dunn, J F, Miller, K, Landman, B A, Shemesh, N, Anderson, A, McKinnon, E, Farquharson, S, Acqua, F D, Pierpaoli, C, Drobnjak, I, Leemans, A, Harkins, K D, Descoteaux, M, Xu, D, Huang, H, Santin, M D, Grant, S C, Obenaus, A, Kim, G S, Wu, D, Bihan, D L, Blackband, S J, Ciobanu, L, Fieremans, E, Bai, R, Leergaard, T B, Zhang, J, Dyrby, T B, Johnson, G A, Cohen-Adad, J, Budde, M D & Jelescu, I O 2025, ' Considerations and recommendations from the ISMRM Diffusion Study Group for preclinical diffusion MRI : Part 3--Ex vivo imaging: data processing, comparisons with microscopy, and tractography ', Magnetic Resonance in Medicine .
Schilling, K G, Howard, A F D, Grussu, F, Ianus, A, Hansen, B, Barrett, R L C, Aggarwal, M, Michielse, S, Nasrallah, F, Syeda, W, Wang, N, Veraart, J, Roebroeck, A, Bagdasarian, A F, Eichner, C, Sepehrband, F, Zimmermann, J, Soustelle, L, Bowman, C, Tendler, B C, Hertanu, A, Jeurissen, B, Verhoye, M, Frydman, L, van de Looij, Y, Hike, D, Dunn, J F, Miller, K, Landman, B A, Shemesh, N, Anderson, A, McKinnon, E, Farquharson, S, Dell'Acqua, F, Pierpaoli, C, Drobnjak, I, Leemans, A, Harkins, K D, Descoteaux, M, Xu, D, Huang, H, Santin, M D, Grant, S C, Obenaus, A, Kim, G S, Wu, D, Le Bihan, D, Blackband, S J, Ciobanu, L, Fieremans, E, Bai, R, Leergaard, T B, Zhang, J, Dyrby, T B, Johnson, G A, Cohen-Adad, J, Budde, M D & Jelescu, I O 2025, 'Considerations and recommendations from the ISMRM Diffusion Study Group for preclinical diffusion MRI : Part 3-Ex vivo imaging: Data processing, comparisons with microscopy, and tractography', Magnetic Resonance in Medicine, vol. 93, no. 6, pp. 2561-2582. https://doi.org/10.1002/mrm.30424
Schilling, K G, Howard, A F D, Grussu, F, Ianus, A, Hansen, B, Barrett, R L C, Aggarwal, M, Michielse, S, Nasrallah, F, Syeda, W, Wang, N, Veraart, J, Roebroeck, A, Bagdasarian, A F, Eichner, C, Sepehrband, F, Zimmermann, J, Soustelle, L, Bowman, C, Tendler, B C, Hertanu, A, Jeurissen, B, Verhoye, M, Frydman, L, van de Looij, Y, Hike, D, Dunn, J F, Miller, K, Landman, B A, Shemesh, N, Anderson, A, McKinnon, E, Farquharson, S, Dell'Acqua, F, Pierpaoli, C, Drobnjak, I, Leemans, A, Harkins, K D, Descoteaux, M, Xu, D, Huang, H, Santin, M D, Grant, S C, Obenaus, A, Kim, G S, Wu, D, Le Bihan, D, Blackband, S J, Ciobanu, L, Fieremans, E, Bai, R, Leergaard, T B, Zhang, J, Dyrby, T B, Johnson, G A, Cohen-Adad, J, Budde, M D & Jelescu, I O 2025, 'Considerations and recommendations from the ISMRM Diffusion Study Group for preclinical diffusion MRI : Part 3—Ex vivo imaging: Data processing, comparisons with microscopy, and tractography', Magnetic Resonance in Medicine, vol. 93, no. 6, pp. 2561-2582. https://doi.org/10.1002/mrm.30424

Témata: TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::neuroimágenes::imagen con tensor de difusión, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::tomografía::imagen por resonancia magnética::imagen de resonancia magnética de difusión, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::microscopía, diffusion tensor, microstructure, tractography, FOS: Physical sciences, physics.med-ph, Signal-To-Noise Ratio, diffusion MRI, ANATOMICAL ACCURACY, MAGNETIC-RESONANCE MICROSCOPY, Imatges - Processament, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Tomography::Magnetic Resonance Imaging::Diffusion Magnetic Resonance Imaging, open science, preclinical, AXON DIAMETER DISTRIBUTION, ORIENTATION DISPERSION, Image Processing, Computer-Assisted, best practices, Animals, Humans, NERVOUS-TISSUE, Computer. Automation, Microscopy, HISTOLOGICAL VALIDATION, Diffusion Magnetic Resonance Imaging/methods, Brain/diagnostic imaging, Image Processing, Computer-Assisted/methods, Diffusion Tensor Imaging/methods, Microscopy/methods, acquisition, ex vivo, processing, Preclinical and Clinical Imaging, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Neuroimaging::Diffusion Tensor Imaging, INFORMATION SCIENCE::Information Science::Computing Methodologies::Image Processing, Computer-Assisted, Brain, Physics - Medical Physics, Microscòpia clínica, CIENCIA DE LA INFORMACIÓN::Ciencias de la información::metodologías computacionales::procesamiento de imágenes asistido por ordenador, Diffusion Magnetic Resonance Imaging, Diffusion Tensor Imaging, Radiology Nuclear Medicine and imaging, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Microscopy, Imatgeria per ressonància magnètica, STRUCTURE TENSOR ANALYSIS, Human medicine, Medical Physics (physics.med-ph), SPINAL-CORD, LIGHT-MICROSCOPY, WHITE-MATTER

Popis souboru: application/pdf

Přístupová URL adresa: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40008460
http://arxiv.org/abs/2411.05021
http://hdl.handle.net/11351/12974
https://dspace.library.uu.nl/handle/1874/460842
http://nbn-resolving.org/urn/resolver.pl?urn=urn:nbn:ch:serval-BIB_AA99E2683A183
https://serval.unil.ch/notice/serval:BIB_AA99E2683A18
https://serval.unil.ch/resource/serval:BIB_AA99E2683A18.P001/REF.pdf
https://hdl.handle.net/10067/2133390151162165141
https://repository.uantwerpen.be/docstore/d:irua:28142
https://pure.au.dk/portal/en/publications/303e2cdf-f5f6-4fd0-a953-d79f6520abd7
https://kclpure.kcl.ac.uk/portal/en/publications/d11e4490-9c34-4760-86f3-92df6316adfe
http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85219588052&partnerID=8YFLogxK
https://pure.au.dk/portal/en/publications/303e2cdf-f5f6-4fd0-a953-d79f6520abd7
https://doi.org/10.1002/mrm.30424

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Digital Microscopy Augmented by Artificial Intelligence to Interpret Bone Marrow Samples for Hematological Diseases

Autoři: David Bermejo-Peláez Sandra Rueda Charro María García Roa a další

Přispěvatelé: David Bermejo-Peláez Sandra Rueda Charro María García Roa a další

Zdroj: Scientia
Scientia. Dipòsit d'Informació Digital del Departament de Salut
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Docta Complutense

Témata: 0301 basic medicine, DISEASES::Hemic and Lymphatic Diseases::Hematologic Diseases, 577.2, 24 Ciencias de la Vida, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::microscopía, Bioquímica (Farmacia), FENÓMENOS Y PROCESOS::conceptos matemáticos::algoritmos::inteligencia artificial, Other subheadings::Other subheadings::/diagnosis, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Clinical Laboratory Techniques::Hematologic Tests::Bone Marrow Examination, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Otros calificadores::Otros calificadores::/diagnóstico, Artificial Intelligence, Bone Marrow, Humans, 577.1, ENFERMEDADES::enfermedades hematológicas y linfáticas::enfermedades hematológicas, Sang - Examen, Microscopy, Intel·ligència artificial - Aplicacions a la medicina, Hematologic Diseases, 3. Good health, Microscòpia clínica, Sang - Malalties - Diagnòstic, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::técnicas de laboratorio clínico::pruebas hematológicas::examen de la médula ósea, Ciencias Biomédicas, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Microscopy, PHENOMENA AND PROCESSES::Mathematical Concepts::Algorithms::Artificial Intelligence, Biología molecular (Farmacia), Algorithms

Popis souboru: application/pdf

Přístupová URL adresa: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38302194
https://hdl.handle.net/11351/11174
https://hdl.handle.net/20.500.14352/101540

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3

Development of an automated artificial intelligence-based system for urogenital schistosomiasis diagnosis using digital image analysis techniques and a robotized microscope

Autoři: Ruiz, Edurne Martínez-Vallejo, Patricia Rubio Maturana, Carles a další

Přispěvatelé: Ruiz, Edurne Martínez-Vallejo, Patricia Rubio Maturana, Carles a další

Zdroj: Scientia

Témata: Microscòpia, Intel·ligència artificial - Aplicacions a la medicina, Imatges - Processament - Tècniques digitals, Esquistosomiasi - Diagnòstic, Aparell urinari - Infeccions - Diagnòstic, DISEASES::Bacterial Infections and Mycoses::Infection::Urinary Tract Infections::Schistosomiasis haematobia, Other subheadings::Other subheadings::/diagnosis, PHENOMENA AND PROCESSES::Mathematical Concepts::Algorithms::Artificial Intelligence, INFORMATION SCIENCE::Information Science::Computing Methodologies::Image Processing, Computer-Assisted, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Microscopy, ENFERMEDADES::infecciones bacterianas y micosis::infección::infecciones urinarias::esquistosomiasis urinaria, Otros calificadores::Otros calificadores::/diagnóstico, FENÓMENOS Y PROCESOS::conceptos matemáticos::algoritmos::inteligencia artificial, CIENCIA DE LA INFORMACIÓN::Ciencias de la información::metodologías computacionales::procesamiento de imágenes asistido por ordenador, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::microscopía

Popis souboru: application/pdf

Relation: PLOS Neglected Tropical Diseases;18(11); https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0012614; info:eu-repo/grantAgreement/ES/PE2017-2020/PI20%2F00217; https://hdl.handle.net/11351/12355; 001348735100002

Dostupnost: https://hdl.handle.net/11351/12355
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0012614

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Development of a low-cost robotized 3D-prototype for automated optical microscopy diagnosis: An open-source system

Autoři: Motta de Carvalho, Bruno JOSEPH, JOAN DANTAS DE OLIVEIRA, ALLISSON a další

Přispěvatelé: Motta de Carvalho, Bruno JOSEPH, JOAN DANTAS DE OLIVEIRA, ALLISSON a další

Zdroj: Scientia

Témata: Microscòpia, Impressió 3D, Robòtica, Automatització, TECHNOLOGY, INDUSTRY, AND AGRICULTURE::Technology, and Agriculture::Technology::Automation, INFORMATION SCIENCE::Information Science::Computing Methodologies::Computer Graphics::Computer-Aided Design::Information Science::Printing, Three-Dimensional, INFORMATION SCIENCE::Information Science::Computing Methodologies::Algorithms::Artificial Intelligence::Robotics, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Microscopy, Other subheadings::Other subheadings::/instrumentation, TECNOLOGÍA, INDUSTRIA Y AGRICULTURA::tecnología, industria y agricultura::tecnología::automatización, CIENCIA DE LA INFORMACIÓN::Ciencias de la información::metodologías computacionales::gráficos por ordenador::diseño asistido por ordenador::Ciencias de la información::impresión tridimensional, CIENCIA DE LA INFORMACIÓN::Ciencias de la información::metodologías computacionales::algoritmos::inteligencia artificial::robótica, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::microscopía, Otros calificadores::Otros calificadores::/instrumentación

Popis souboru: application/pdf

Relation: PLOS ONE;19(6); https://doi.org/10.1371/journal.pone.0304085; https://hdl.handle.net/11351/11645

Dostupnost: https://hdl.handle.net/11351/11645
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0304085

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Evaluation of an Artificial Intelligence-Based Tool and a Universal Low-Cost Robotized Microscope for the Automated Diagnosis of Malaria

Autoři: Martínez-Vallejo, Patricia GOTERRIS, LIDIA Muixí, Marc a další

Přispěvatelé: Martínez-Vallejo, Patricia GOTERRIS, LIDIA Muixí, Marc a další

Zdroj: Scientia

Témata: Intel·ligència artificial - Aplicacions a la medicina, Microscòpia clínica, Malària - Diagnòstic, Robòtica en medicina, PHENOMENA AND PROCESSES::Mathematical Concepts::Algorithms::Artificial Intelligence, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Microscopy, DISEASES::Parasitic Diseases::Protozoan Infections::Malaria, Other subheadings::Other subheadings::/diagnosis, INFORMATION SCIENCE::Information Science::Computing Methodologies::Algorithms::Artificial Intelligence::Robotics, FENÓMENOS Y PROCESOS::conceptos matemáticos::algoritmos::inteligencia artificial, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::microscopía, ENFERMEDADES::enfermedades parasitarias::infecciones por protozoos::malaria, Otros calificadores::Otros calificadores::/diagnóstico, CIENCIA DE LA INFORMACIÓN::Ciencias de la información::metodologías computacionales::algoritmos::inteligencia artificial::robótica

Popis souboru: application/pdf

Relation: International Journal of Environmental Research and Public Health;22(1); https://doi.org/10.3390/ijerph22010047; http://hdl.handle.net/11351/12763

Dostupnost: http://hdl.handle.net/11351/12763
https://doi.org/10.3390/ijerph22010047

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Diagnostic accuracy of qPCR and microscopy for cutaneous leishmaniasis in rural Ecuador: A Bayesian latent class analysis

Autoři: Merckx, Joanna de Vries, Henry J. C. Bezemer, Jacob Machiel a další

Přispěvatelé: Merckx, Joanna de Vries, Henry J. C. Bezemer, Jacob Machiel a další

Zdroj: Scientia

Témata: Leishmaniosi - Diagnòstic, ADN, Microscòpia clínica, DISEASES::Parasitic Diseases::Protozoan Infections::Euglenozoa Infections::Leishmaniasis::Leishmaniasis, Cutaneous, Other subheadings::Other subheadings::/diagnosis, CHEMICALS AND DRUGS::Nucleic Acids, Nucleotides, and Nucleosides::Nucleic Acids::DNA, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Microscopy, ENFERMEDADES::enfermedades parasitarias::infecciones por protozoos::infecciones por Euglenozoa::leishmaniosis::leishmaniasis cutánea, Otros calificadores::Otros calificadores::/diagnóstico, COMPUESTOS QUÍMICOS Y DROGAS::nucleótidos y nucleósidos de ácidos nucleicos::ácidos nucleicos::ADN, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::microscopía

Popis souboru: application/pdf

Relation: PLoS Neglected Tropical Diseases;17(11); https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011745; Bezemer JM, Merckx J, Freire Paspuel BP, Calvopiña M, de Vries HJC, Schallig HDFH, et al. Diagnostic accuracy of qPCR and microscopy for cutaneous leishmaniasis in rural Ecuador: A Bayesian latent class analysis. PLoS Negl Trop Dis. 2023 Nov 29;17(11):e0011745.; https://hdl.handle.net/11351/10840

Dostupnost: https://hdl.handle.net/11351/10840
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011745

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Advances and challenges in automated malaria diagnosis using digital microscopy imaging with artificial intelligence tools: A review

Autoři: Bilalli, Besim Espasa Soley, Mateu Sulleiro Igual, Elena a další

Přispěvatelé: Bilalli, Besim Espasa Soley, Mateu Sulleiro Igual, Elena a další

Zdroj: Scientia

Témata: Malària - Diagnòstic, Intel·ligència artificial - Aplicacions a la medicina, Microscòpia clínica, INFORMATION SCIENCE::Information Science::Computing Methodologies::Algorithms::Artificial Intelligence, DISEASES::Parasitic Diseases::Protozoan Infections::Malaria, Other subheadings::Other subheadings::/diagnosis, ANALYTICAL, DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC TECHNIQUES, AND EQUIPMENT::Diagnosis::Diagnostic Techniques and Procedures::Diagnostic Imaging::Microscopy, CIENCIA DE LA INFORMACIÓN::Ciencias de la información::metodologías computacionales::algoritmos::inteligencia artificial, ENFERMEDADES::enfermedades parasitarias::infecciones por protozoos::malaria, Otros calificadores::Otros calificadores::/diagnóstico, TÉCNICAS Y EQUIPOS ANALÍTICOS, DIAGNÓSTICOS Y TERAPÉUTICOS::diagnóstico::técnicas y procedimientos diagnósticos::diagnóstico por imagen::microscopía

Popis souboru: application/pdf

Relation: Frontiers in Microbiology;13; https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.1006659; Maturana CR, de Oliveira AD, Nadal S, Bilalli B, Serrat FZ, Soley ME, et al. Advances and challenges in automated malaria diagnosis using digital microscopy imaging with artificial intelligence tools: A review. Front Microbiol. 2022 Nov 15;13:1006659.; https://hdl.handle.net/11351/8717; 000891882500001

Dostupnost: https://hdl.handle.net/11351/8717
https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.1006659

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An in vitro iron superoxide dismutase inhibitor decreases the parasitemia levels of Trypanosoma cruzi in BALB/c mouse model during acute phase

Autoři: Olmo, Francisco Urbanová, Kristína Rosales, Maria Jose a další

Přispěvatelé: Olmo, Francisco Urbanová, Kristína Rosales, Maria Jose a další

Zdroj: Int J Parasitol Drugs Drug Resist
RISalud-ANDALUCIA. Repositorio Institucional de Salud de Andalucía
instname
International Journal for Parasitology: Drugs and Drug Resistance, Vol 5, Iss 3, Pp 110-116 (2015)